Alpha Zone to zręcznościowa gra FPP, której akcja rozgrywa się na skolonizowanej przez ludzi planecie w odległym układzie Alpha. Kolonia została napadnięta przez nieznaną rasę obcych. Sytuacja jest tragiczna, nie ma szans na utrzymanie planety, a pozostali przy życiu mieszkańcy zostają właśnie ewakuowani upadających miast.

Gracz wciela się w agenta jednostki specjalnej, który ma za zadanie zniszczyć centrum dowodzenia, gdzie znajdują się informacje mogące posłużyć obcym do inwazji na inne kolonie ziemskie.

Celem jest przedostanie się przez 4 strefy do serca kolonii - Multi Reaktora. Jego zniszczenie pociągnie za sobą destrukcję całego kompleksu dowodzenia, a tym samym uniemożliwi obcym dostęp do niebezpiecznych informacji.